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OSUG - Terre Univers Environnement

Thématiques

13 septembre 2013 ( dernière mise à jour : 31 janvier 2014 )

L’équipe GBA s’intéresse aux mécanismes de l’adaptation des organismes à leur environnement, et cherche à lier les traits adaptatifs (phénotypes) aux gènes impliqués. Pour cela, des approches de criblage génomique haut débit sont couplées à des approches de génétique quantitative, de génétique des populations, et/ou de génomique fonctionnelle (voir schéma synthétique de notre démarche ci dessous). L’équipe possède des compétences dans le développement et l’utilisation de marqueurs moléculaires (ex : séquence, microsatellite, SNP, AFLP) et des outils bio-informatiques adéquats pour leur analyse, ainsi que dans le développement et l’application de nouvelles méthodes statistiques en génétique des populations.

Notre objectif principal est de répondre à des questions fondamentales en biologie évolutive et en biologie de la conservation.

Les modèles développés actuellement sont :
1) mécanismes d’adaptation des plantes alpines à leur environnement dans un contexte de réchauffement climatique, notamment en marge de leur aire de distribution.
2) génétique de l’adaptation des insectes aux insecticides.
3) génétique de la domestication (chèvres et moutons).

Pour répondre à ces questions nous mettons en avant :
i) une approche de génomique des populations avec criblage du génome pour rechercher des régions chromosomiques (voire les gènes) impliqués dans les processus adaptatifs
ii) l’analyse spatiale des données génétiques, en cherchant à intégrer les variables environnementales.
iii) iii) des expérimentations au laboratoire ou in situ pour mettre en évidence l’existence d’adaptation locale sur différents traits des organismes étudiés.

Ces questions nous impliquent dans des projets Européens, nationaux et régionaux :

Coordination LECA :
- European project NextGen (2010 – 2014) Pierre Taberlet
- European project CONGRESS (2010-2013) Oscar Gaggiotti
- ANR CES DIBBECO (2009-2011) Laurence Després

Autres :
- European project AvecNet (2011-2014)
- ANR GWAPHID (2010-2013)
- ANR SCION
- ANR EVORANGE




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