English

Accueil > Recherche > Thèmes (2016- ) > MALBIO




Rechercher

OSUG - Terre Univers Environnement

MALBIO

Mathématiques et algorithmique pour l’étude de la biodiversité

Animateur : Eric COISSAC

Le thème de recherche MALBIO développe de nouvelles approches mathématiques, statistiques et informatiques pour analyser les données de séquences NGS dans le contexte de la recherche en écologie. L’arrivée des nouvelles méthodes de séquençage haut débit demande d’investir de nouveaux efforts de recherche dans l’analyse de séquences d’ADN du fait du volume de données produites qui défie les algorithmes classiques et augmente les champ d’application du séquençage ADN. Le LECA offre un environnement idéal au développement d’algorithmes liés à l’évaluation de la biodiversité intra et inter spécifique.

Trois grands axes sont développés au sein du groupe :

  1. Le développement d’algorithmes pour le Metabarcoding ADN.
  2. Le développement d’algorithmes pour l’analyse des séquences génomiques à faible couverture (genome skimming)
  3. Le développement d’algorithmes pour analyser le séquençage individuel de génomes complet

Sous la tutelle de :



Crédit et mentions légales | Contact | Plan du site | © OSUG  2017